LA FUNDACIÓN CENTRO MÉDICO DE ASTURIAS DESARROLLA UN NUEVO MÉTODO PARA EL DIAGNÓSTICO GENÉTICO DE LA SORDOCEGUERA), CONTRIBUYE A LA CREACIÓN DE UN ATLAS DE MODELOS CELULARES PARA ESTUDIAR EL CÁNCER.
El equipo del Laboratorio de I+D de la Fundación Centro Médico de Asturias (FCMA) ha publicado recientemente los resultados de un estudio de investigación en el cual han diseñado y validado clínicamente una nueva metodología para el diagnóstico genético de la sordoceguera. El estudio ha contado con la financiación de la Fundación María Cristina Masaveu Peterson y de la ONCE, ha sido dirigido por el Dr. Cadiñanos, de la FCMA, y en él han participado investigadores de la FCMA, del Hospital Centro Médico de Asturias, del Instituto Oftalmológico Fernández-Vega y de los hospitales universitarios Central de Asturias y Marqués de Valdecilla.
La nueva estrategia combina las ventajas de dos de los métodos más frecuentemente utilizados para el diagnóstico genético mediante secuenciación de nueva generación: la secuenciación del exoma completo y el análisis de paneles de genes. La secuenciación del exoma completo analiza las regiones codificantes (las que determinan las secuencias de aminoácidos de las proteínas) de los 21.000 genes del genoma, mientras que los paneles de genes analizan decenas/cientos de genes previamente asociados de manera específica con las patologías de estudio en el paciente, pudiendo incluir tanto regiones codificantes como regiones no codificantes vinculadas con esas patologías.
El equipo de investigación ha partido de un diseño que permite analizar exomas completos y lo ha complementado para incluir las regiones no codificantes de los genes asociados con sordera y/o ceguera, así como el genoma completo de las mitocondrias. Este diseño, al que llamado exoma-enriquecido, permite secuenciar todas las regiones genéticas conocidas clínicamente asociadas con la sordera y la ceguera (lo que lo hace adecuado para el diagnóstico genético de estas patologías), así como las regiones codificantes de todos los genes del genoma (lo que lo hace útil para el descubrimiento de nuevos genes implicados en sordera y/o ceguera). Asimismo, la disponibilidad de datos de todos los genes permite revisar periódicamente los resultados obtenidos en un paciente determinado, para explorar la posibilidad de que tenga alguna variante causante de su enfermedad, que afecte a un gen que se haya asociado a la sordera o la ceguera posteriormente a la realización del análisis genético inicial del paciente.
Para comprobar la utilidad del nuevo diseño, los investigadores de la FCMA han analizado muestras de 24 pacientes con sordoceguera. En 10 de ellos ya se conocían las causas genéticas responsables de sus pérdidas de audición y visión, que habían sido previamente identificadas mediante los paneles OTOgenicsTM y/u OFTALMOgenicsTM (que analizan solo genes implicados en sordera o ceguera, respectivamente). Otros 10 habían sido analizados previamente por los paneles OTOgenicsTM y/u OFTALMOgenicsTM, pero con resultados negativos, mientras que los 4 últimos no habían sido analizados genéticamente con anterioridad. Los resultados fueron muy positivos, identificándose la causa de la sordera y/o ceguera en los 10 primeros pacientes (lo que validó el correcto funcionamiento método), en 3 de los 10 segundos y en los últimos 4.
En 2 de los 3 casos previamente analizados con OTOgenics y/u OFTAMOgenics en los que el exoma enriquecido encontró la causa de la sordera y/o la ceguera, el gen considerado responsable no se había incluido en los análisis con OTOgenicsTM y OFTALMOgenicsTM realizados previamente porque no se conocía su implicación en estas patologías en el momento de analizar al paciente. En uno de ellos, la alteración identificada mediante los exomas enriquecidos no solo explicaba la ceguera, sino también la distrofia muscular diagnosticada en la paciente. En el último de estos 3 casos, que se había analizado previamente con OFTALMOgenicsTM, la alteración identificada no causa sordoceguera, sino únicamente sordera, razón por la cual no se incluyó en el análisis inicial.
Además de la demostrada utilidad diagnóstica de esta nueva estrategia, los datos del exoma completo obtenidos en los pacientes sin diagnóstico genético tras su análisis con exomas enriquecidos podrán ser útiles en estudios futuros de investigación orientados a identificar nuevos genes asociados a sordera y/o ceguera.
En definitiva, la metodología utilizada en este estudio, que puede ser extrapolada a cualquier otra patología con base genética, combina las ventajas de los estudios específicos de la enfermedad de cada paciente (como los paneles de genes), con las de los análisis amplios obtenidos mediante la secuenciación del exoma completo. Los detalles metodológicos y los resultados del estudio han sido publicados recientemente en la revista Genes: www.mdpi.com/2073-4425/17/3/344
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